Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMCO1Q147U7 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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