Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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NCOA4Q13772 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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