Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CUL3Q13618 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms