Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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SF3B2Q13435 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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SF3B2Q13435 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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SF3B2Q13435 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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SF3B2Q13435 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SF3B2Q13435 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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