Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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IFT88Q13099 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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IFT88Q13099 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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IFT88Q13099 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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IFT88Q13099 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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IFT88Q13099 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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IFT88Q13099 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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