Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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GPS1Q13098 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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GPS1Q13098 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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GPS1Q13098 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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GPS1Q13098 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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GPS1Q13098 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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GPS1Q13098 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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GPS1Q13098 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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