Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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