Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KCNH2Q12809 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KCNH2Q12809 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KCNH2Q12809 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KCNH2Q12809 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KCNH2Q12809 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KCNH2Q12809 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KCNH2Q12809 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KCNH2Q12809 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KCNH2Q12809 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
KCNH2Q12809 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
KCNH2Q12809 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
KCNH2Q12809 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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KCNH2Q12809 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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KCNH2Q12809 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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KCNH2Q12809 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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KCNH2Q12809 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KCNH2Q12809 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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