Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms