Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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