Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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