Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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PKHD1P08F94 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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PKHD1P08F94 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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PKHD1P08F94 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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PKHD1P08F94 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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PKHD1P08F94 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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PKHD1P08F94 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
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PKHD1P08F94 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
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