Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AL353653.1-202ENST00000435177 539 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC123904.1-201ENST00000441072 368 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC098828.2-201ENST00000452342 573 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 WBP1LP1-201ENST00000460451 896 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 RN7SL740P-201ENST00000467060 344 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 ANKRD55-205ENST00000513241 626 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 RN7SKP14-201ENST00000516000 329 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC114550.1-201ENST00000518846 573 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 LINC02322-201ENST00000554773 338 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 IGHV1OR15-4-201ENST00000560037 348 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC000068.3-201ENST00000607934 427 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC134981.1-201ENST00000628076 348 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 PCBP1-AS1-322ENST00000628147 553 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 PACRG-202ENST00000366888 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 KIT-201ENST00000288135 5186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 CTAGE3P-201ENST00000454280 2404 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 ZNF10-202ENST00000402932 1967 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
SNPHO15079 ZNF234-201ENST00000426739 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SNPHO15079 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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SNPHO15079 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LINC00851-201ENST00000423033 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC092802.3-201ENST00000434207 420 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SNPHO15079 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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SNPHO15079 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SNPHO15079 AC111198.1-201ENST00000505575 606 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SNPHO15079 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MIR3689F-201ENST00000579617 66 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LINC01198-208ENST00000599175 560 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 OR7A18P-201ENST00000600416 277 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 7SK.12-201ENST00000612820 244 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 NUDT13-208ENST00000617744 928 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC079456.1-201ENST00000624010 480 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LRRC2-AS1-201ENST00000599511 2291 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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