Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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SH3BP1Q9Y3L3 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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