Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms