Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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