Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHD4Q14839 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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CHD4Q14839 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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CHD4Q14839 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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CHD4Q14839 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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CHD4Q14839 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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CHD4Q14839 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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