Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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CDH18Q13634 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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