Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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TOP3AQ13472 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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TOP3AQ13472 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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TOP3AQ13472 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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TOP3AQ13472 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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TOP3AQ13472 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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