Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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