Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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