Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 OPALIN-206ENST00000611913 3115 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 LINC00294-201ENST00000631190 3306 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 GRHL1-201ENST00000324907 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 NLRP9-201ENST00000332836 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 CERS6-AS1-201ENST00000425636 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 PRICKLE2-AS3-201ENST00000473434 2496 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 GLS2-215ENST00000539272 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC027097.2-201ENST00000588925 1976 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 CCNB2-205ENST00000621385 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RRM2-201ENST00000304567 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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