Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TTPAP49638 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TTPAP49638 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TTPAP49638 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TTPAP49638 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TTPAP49638 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TTPAP49638 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TTPAP49638 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TTPAP49638 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TTPAP49638 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TTPAP49638 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TTPAP49638 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TTPAP49638 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TTPAP49638 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TTPAP49638 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TTPAP49638 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms