Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ACADSBP45954 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms