Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MCM10-206ENST00000484800 3157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 AZIN1-202ENST00000347770 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 DHFR2-202ENST00000394221 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 PTPRR-203ENST00000378778 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 AL158206.1-201ENST00000563205 1965 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 TIMM21-204ENST00000580087 2524 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TRHP20396 IL1RL1-203ENST00000404917 3571 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TRHP20396 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TRHP20396 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TRHP20396 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TRHP20396 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TRHP20396 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC016722.3-201ENST00000568862 2463 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 SLFN12-202ENST00000394562 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 ZNF415-213ENST00000597503 2469 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 TMEM106A-208ENST00000612339 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 BCLAF1-223ENST00000628517 2512 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRHP20396 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 CELF1-215ENST00000532048 3044 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 PIGN-231ENST00000639174 4095 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms