Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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PKHD1P08F94 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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