Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
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