Protein–RNA interactions for Protein: R4GNA1

MINOS1-NBL1, MICOS complex subunit MIC10 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINOS1-NBL1R4GNA1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MINOS1-NBL1R4GNA1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms