Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms