Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
THSD7AQ9UPZ6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THSD7AQ9UPZ6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms