Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT8

ZC3H4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H4Q9UPT8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H4Q9UPT8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms