Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHIC2Q9UKJ5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms