Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HACL1Q9UJ83 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACL1Q9UJ83 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms