Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms