Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms