Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DKK2Q9UBU2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms