Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms