Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARHGEF12Q9NZN5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGEF12Q9NZN5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms