Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRPM3Q9HCF6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRPM3Q9HCF6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms