Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UPF2Q9HAU5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPF2Q9HAU5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms