Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
NRDE2Q9H7Z3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRDE2Q9H7Z3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms