Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFDQ9GZP0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
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