Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRIP1Q9BX63 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms