Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms