Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGIP1Q9BQI5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms