Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYD88Q99836 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms