Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms