Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC10A4Q96EP9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms