Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms