Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMO7Q8WWI1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMO7Q8WWI1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMO7Q8WWI1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMO7Q8WWI1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms